Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmlQ9QZD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms