Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms