Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacl1Q9QXE0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms