Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWI6

Srcin1, SRC kinase signaling inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srcin1Q9QWI6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srcin1Q9QWI6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srcin1Q9QWI6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srcin1Q9QWI6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms