Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms