Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms