Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc42ep4Q9JM96 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms