Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms