Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms