Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms