Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms