Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms