Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ap3m1Q9JKC8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3m1Q9JKC8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms