Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms