Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc86Q9JJ89 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc86Q9JJ89 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms