Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms