Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz2Q9JHH9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms