Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp6Q9ESX2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms