Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmtm7Q9ESD6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm7Q9ESD6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm7Q9ESD6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm7Q9ESD6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm7Q9ESD6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm7Q9ESD6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms