Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp29Q9ES63 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp29Q9ES63 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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