Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhojQ9ER71 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhojQ9ER71 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms