Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn2Q9ER65 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn2Q9ER65 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms