Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef4Q9EQZ6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms