Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnn1Q9EQR3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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