Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tlr1Q9EPQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tlr1Q9EPQ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tlr1Q9EPQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tlr1Q9EPQ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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