Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgap1Q9EPJ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms