Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan4Q9DCK3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms