Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms