Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med29Q9DB91 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms