Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms