Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rhobtb1Q9DAK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhobtb1Q9DAK3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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