Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo2Q9D8S4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms