Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms