Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn23Q9D7D7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms