Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl40Q9D783 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms