Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms