Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf1dQ9D4V4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Taf1dQ9D4V4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1dQ9D4V4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms