Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2lQ9D478 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms