Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms