Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms