Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
5430402E10RikQ9D3N5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430402E10RikQ9D3N5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms