Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rufy3Q9D394 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms