Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt20Q9D312 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms