Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Creb3l4Q9D2A5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms