Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D1K7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1K7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms