Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1F3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1F3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D1F3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms