Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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