Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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