Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms