Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Bud23Q9CY21 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bud23Q9CY21 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms